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济宁市农科院林果与中药材研究所为市级科研机构，其前身为林果与花卉研究所，2019年机构改革后更名为林果与中药材研究所。本所主要致力于林果及中药材种质资源的收集、保存、鉴定评价与利用及绿色增产增效技术研究与示范推广等工作；承担国家、省、市现代农业产业技术体系试验研究和示范推广工作。

现有职工6人，其中高级职称2人，中级职称2人，硕士研究生2人。拥有山东省现代农业产业技术体系中草药创新团队济宁综合试验站和济宁市现代农业产业技术体系中药材创新团队等省市级研发平台。先后与山东省农科院、山东省中医药大学、山东农业大学等科研机构建立了科研协作关系。

主持并获得省、市级科研成果奖励6项；通过国家发明专利5项，实用新型专利授权2项；先后在《山东农业科学》、《浙江农业科学》、《安徽农业科学》、《农业科技通讯》等期刊发表论文20余篇。